Käytännössä työ niveltyy jokaisen opettajan arkeen ja opetuksen kehittämistyöhön, sen tärkeimpänä toteuttajana ovat oppiainekohtaiset jaostot (hankkeen aikana 49 kpl). Kansallista työtä koordinoi yliopistojen yhteinen koordinaattori. Työn tavoitteet ja suuntaviivat sovitaan yhteisesti MEDigi-työn toimenpideohjelmassa. Kehittämistyö perustuu tutkimusperustaisuuteen, jossa keskeistä on opetuksen sisällön ja opetusmenetelmien pohjautuminen tieteelliseen tietoon, opetuksen ja oppimisprosessin jatkuva tutkiminen ja kehittäminen sekä työelämävuorovaikutus.